Embedded binary is not signed with the same certificate as the parent app. Verify the embedded binary target’s code sign settings match the parent app’s.
だいたいAutomaticallyにしてるとうまくいってますが、
こんなメッセージが出て、Extensionと本体で異なるような感じが消えてくれない場合。
Automaticallyのチェックを外し、Debugを選択してApple Developmentの、Releaseを選択してApple Distributionの、２種類のProvisioning Profileを、本体とExtensionでちゃんとセットすると、うまくいきました。